Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms