Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3G3X939 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc9a3G3X939 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a3G3X939 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3G3X939 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3G3X939 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a3G3X939 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a3G3X939 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms