Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim15G3UY57 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim15G3UY57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim15G3UY57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim15G3UY57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim15G3UY57 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms