Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933402N22RikF7D1B3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933402N22RikF7D1B3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933402N22RikF7D1B3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402N22RikF7D1B3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402N22RikF7D1B3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402N22RikF7D1B3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms