Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcdh11xF6ZNL5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcdh11xF6ZNL5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pcdh11xF6ZNL5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcdh11xF6ZNL5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcdh11xF6ZNL5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcdh11xF6ZNL5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcdh11xF6ZNL5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pcdh11xF6ZNL5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms