Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Crocc2F6XLV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Crocc2F6XLV1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Crocc2F6XLV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Crocc2F6XLV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Crocc2F6XLV1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Crocc2F6XLV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Crocc2F6XLV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Crocc2F6XLV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Crocc2F6XLV1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Crocc2F6XLV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Crocc2F6XLV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Crocc2F6XLV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Crocc2F6XLV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Crocc2F6XLV1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Crocc2F6XLV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Crocc2F6XLV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Crocc2F6XLV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Crocc2F6XLV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms