Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17555F6U8B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17555F6U8B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17555F6U8B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17555F6U8B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm17555F6U8B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17555F6U8B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms