Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa27F2Z403 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa27F2Z403 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa27F2Z403 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa27F2Z403 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa27F2Z403 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms