Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TrdnE9Q9K5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TrdnE9Q9K5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TrdnE9Q9K5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TrdnE9Q9K5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TrdnE9Q9K5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TrdnE9Q9K5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TrdnE9Q9K5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TrdnE9Q9K5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TrdnE9Q9K5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TrdnE9Q9K5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TrdnE9Q9K5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms