Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700080E11RikE9Q9G1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700080E11RikE9Q9G1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700080E11RikE9Q9G1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700080E11RikE9Q9G1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700080E11RikE9Q9G1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700080E11RikE9Q9G1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700080E11RikE9Q9G1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700080E11RikE9Q9G1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700080E11RikE9Q9G1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700080E11RikE9Q9G1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700080E11RikE9Q9G1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms