Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BC005561E9Q5E2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
BC005561E9Q5E2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
BC005561E9Q5E2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
BC005561E9Q5E2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
BC005561E9Q5E2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
BC005561E9Q5E2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BC005561E9Q5E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
BC005561E9Q5E2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
BC005561E9Q5E2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
BC005561E9Q5E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
BC005561E9Q5E2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
BC005561E9Q5E2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
BC005561E9Q5E2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms