Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd2E9Q1M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdzd2E9Q1M1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pdzd2E9Q1M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzd2E9Q1M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd2E9Q1M1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzd2E9Q1M1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1074 ms