Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9972E9Q053 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm9972E9Q053 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9972E9Q053 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9972E9Q053 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm9972E9Q053 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm9972E9Q053 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.6 ms