Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ift140E9PY46 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ift140E9PY46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ift140E9PY46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ift140E9PY46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ift140E9PY46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ift140E9PY46 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ift140E9PY46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ift140E9PY46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ift140E9PY46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ift140E9PY46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ift140E9PY46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ift140E9PY46 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ift140E9PY46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Ift140E9PY46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Ift140E9PY46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Ift140E9PY46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ift140E9PY46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms