Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU018091E9PWS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AU018091E9PWS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU018091E9PWS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AU018091E9PWS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AU018091E9PWS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AU018091E9PWS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms