Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim30dE9PWL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms