Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim5E9PV98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim5E9PV98 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trim5E9PV98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim5E9PV98 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim5E9PV98 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim5E9PV98 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim5E9PV98 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim5E9PV98 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim5E9PV98 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim5E9PV98 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim5E9PV98 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim5E9PV98 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim5E9PV98 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim5E9PV98 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim5E9PV98 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim5E9PV98 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms