Protein–RNA interactions for Protein: E9PV85

Amy2a1, Amylase 2a1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy2a1E9PV85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amy2a1E9PV85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amy2a1E9PV85 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amy2a1E9PV85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amy2a1E9PV85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amy2a1E9PV85 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.7 ms