Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifit3bE9PV48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifit3bE9PV48 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3bE9PV48 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifit3bE9PV48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit3bE9PV48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms