Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim20D3Z7Q2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim20D3Z7Q2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim20D3Z7Q2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms