Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930595D18RikD3Z642 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930595D18RikD3Z642 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930595D18RikD3Z642 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930595D18RikD3Z642 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930595D18RikD3Z642 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930595D18RikD3Z642 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
4930595D18RikD3Z642 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930595D18RikD3Z642 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930595D18RikD3Z642 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms