Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms