Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc13D3YV10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc13D3YV10 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc13D3YV10 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc13D3YV10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc13D3YV10 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc13D3YV10 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc13D3YV10 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1902.2 ms