Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d4D3YUH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d4D3YUH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d4D3YUH6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d4D3YUH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d4D3YUH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms