Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Cttnbp2B9EJA2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Cttnbp2B9EJA2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
Cttnbp2B9EJA2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Cttnbp2B9EJA2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Cttnbp2B9EJA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Cttnbp2B9EJA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Cttnbp2B9EJA2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Cttnbp2B9EJA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Cttnbp2B9EJA2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Cttnbp2B9EJA2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Cttnbp2B9EJA2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Cttnbp2B9EJA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cttnbp2B9EJA2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cttnbp2B9EJA2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cttnbp2B9EJA2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms