Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnldc1B2RXZ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnldc1B2RXZ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pnldc1B2RXZ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pnldc1B2RXZ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms