Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabrr3B2RXA8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrr3B2RXA8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabrr3B2RXA8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabrr3B2RXA8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabrr3B2RXA8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabrr3B2RXA8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrr3B2RXA8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabrr3B2RXA8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabrr3B2RXA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms