Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itih4A6X935 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itih4A6X935 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itih4A6X935 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itih4A6X935 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itih4A6X935 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itih4A6X935 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itih4A6X935 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms