Protein–RNA interactions for Protein: A6BLY7

Krt28, Keratin, type I cytoskeletal 28, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt28A6BLY7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krt28A6BLY7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt28A6BLY7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Krt28A6BLY7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt28A6BLY7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt28A6BLY7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Krt28A6BLY7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt28A6BLY7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Krt28A6BLY7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Krt28A6BLY7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krt28A6BLY7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Krt28A6BLY7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms