Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pramef17A2ASJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pramef17A2ASJ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pramef17A2ASJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef17A2ASJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pramef17A2ASJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pramef17A2ASJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pramef17A2ASJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms