Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn34c4A2ANA3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn34c4A2ANA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c4A2ANA3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c4A2ANA3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms