Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
GabreA2AMW3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
GabreA2AMW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,26■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,22■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
GabreA2AMW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
GabreA2AMW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
GabreA2AMW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
GabreA2AMW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
GabreA2AMW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
GabreA2AMW3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,12■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
GabreA2AMW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,02■■■□□ 2,24
GabreA2AMW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
GabreA2AMW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
GabreA2AMW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
GabreA2AMW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
GabreA2AMW3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
GabreA2AMW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
GabreA2AMW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
GabreA2AMW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
GabreA2AMW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,8 ms