Protein–RNA interactions for Protein: A2AIL4

Ndufaf6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf6A2AIL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf6A2AIL4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufaf6A2AIL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufaf6A2AIL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf6A2AIL4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufaf6A2AIL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms