Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930447F04RikA2AFR2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930447F04RikA2AFR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms