Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem185aA2AF53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem185aA2AF53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem185aA2AF53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem185aA2AF53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms