Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calcoco2A2A6M5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calcoco2A2A6M5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calcoco2A2A6M5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calcoco2A2A6M5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calcoco2A2A6M5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calcoco2A2A6M5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calcoco2A2A6M5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms