Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krtap1-3A2A588 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap1-3A2A588 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap1-3A2A588 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Krtap1-3A2A588 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Krtap1-3A2A588 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms