Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cul4bA2A432 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul4bA2A432 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul4bA2A432 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul4bA2A432 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul4bA2A432 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul4bA2A432 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul4bA2A432 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul4bA2A432 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cul4bA2A432 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cul4bA2A432 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul4bA2A432 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms