Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trav12-2A0N8N6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav12-2A0N8N6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trav12-2A0N8N6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trav12-2A0N8N6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trav12-2A0N8N6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav12-2A0N8N6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trav12-2A0N8N6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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