Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4921501E09RikA0A0R4J054 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4921501E09RikA0A0R4J054 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms