Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ighv1-18A0A0A6YXN4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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