Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ccdc18Q640L5 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms