Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms