Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Ccdc18Q640L5 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
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