Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd9P28357 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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