Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Pde6aP27664 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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