Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 ASTE1-201ENST00000264992 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 ATXN7L1-201ENST00000318724 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 OR2S2-201ENST00000341959 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 ZNF70P1-201ENST00000417480 624 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 MRPS31P5-202ENST00000423686 920 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 NBPF19-202ENST00000426482 2344 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 CTBP2P2-201ENST00000434549 1334 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 HNRNPA1P39-201ENST00000440547 960 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 LINC01696-201ENST00000448988 492 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 VIPR1-AS1-201ENST00000452639 1435 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 C2orf74-205ENST00000488469 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC093152.1-201ENST00000495684 564 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 IGKV2-14-201ENST00000517571 347 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 TATDN3-207ENST00000526641 1073 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 LINC01499-202ENST00000529282 563 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 LINC01499-203ENST00000530379 555 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 RBM4B-207ENST00000531969 769 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 LINC02359-201ENST00000545642 643 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 PLCB2-AS1-201ENST00000559520 568 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC010542.1-201ENST00000568430 555 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 FAM95B1-204ENST00000586273 798 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AL365214.3-204ENST00000587816 894 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 FAM95B1-207ENST00000589112 768 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 GMFG-204ENST00000595636 487 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 CCL17-202ENST00000616880 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 FAM74A4-202ENST00000618177 469 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 AC141557.2-201ENST00000621330 482 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 REN-202ENST00000638118 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTGFRP43088 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MKNK1-AS1-201ENST00000602433 2445 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GLT8D1-202ENST00000394783 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PSG8-204ENST00000406636 1610 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 IBSP-201ENST00000226284 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ALDH7A1P1-201ENST00000510973 1533 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KCNK2-201ENST00000391894 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CDCA3-204ENST00000535406 1327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 IL13-201ENST00000304506 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SLC25A26-203ENST00000413054 1096 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC079834.1-201ENST00000414016 421 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FAM136BP-201ENST00000428729 417 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC009078.1-201ENST00000474978 783 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ACOT9-207ENST00000492081 683 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC00900-202ENST00000501294 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC106872.7-201ENST00000508621 312 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC079238.1-201ENST00000509840 1009 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC107074.1-201ENST00000513617 764 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC103719.1-201ENST00000517994 581 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AP003122.1-201ENST00000527402 755 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TMIGD1-202ENST00000538566 1124 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC087321.1-201ENST00000539105 460 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC073612.1-201ENST00000548802 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC136469.1-201ENST00000595706 511 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC034198.2-201ENST00000606447 510 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CCL4L2-213ENST00000617405 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LAMTOR5-AS1-236ENST00000626261 464 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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