Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms