Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Col5a3Q9JLI2 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Col5a3Q9JLI2 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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