Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ilf3Q9Z1X4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms